Kapsułki miękkie mogą być wypełnione różnymi olejkami lub lekami płynnymi lub zawiesinami nierozpuszczalnymi żelatyny, lub mogą być wypełnione lekami stałymi. Zawartość cieczy można podzielić na trzy kategorie:
(1) Lotne lub nielotne-ciecze niemieszające się z wodą, takie jak oleje roślinne lub olejki aromatyczne.
(2) Nielotne ciecze mieszające się z wodą, takie jak glikol polietylenowy i niejonowe środki powierzchniowo czynne.
(3) Związki mieszalne z wodą, ale o niskiej lotności, takie jak glicerol, glikol propylenowy i izopropanol.
Leki często absorbują wodę, co może zmieniać zawartość wilgoci w miękkiej otoczce kapsułki. Jeśli lek jest hydrofilowy, powinien zatrzymywać 5% wody. Oleje są powszechnie stosowane jako rozpuszczalniki lub środki zawieszające leki. Chociaż kapsułki miękkie wypełnione olejem-nie zawierają wody, wilgoć lub woda z otoczki może przedostać się przez ściankę kapsułki. Jeśli lek jest hydrofilowy, powinien zatrzymywać 3% wody. Jeśli lek w płynie zawiera więcej niż 50% wody lub zawiera lotne rozpuszczalniki o niskiej masie cząsteczkowej, które mieszają się z wodą, takie jak etanol, aceton, aminy, kwasy i estry, może zmiękczyć lub rozpuścić miękkie kapsułki. Dlatego nie nadaje się do wytwarzania kapsułek miękkich. Podczas napełniania płynnych leków pH powinno być kontrolowane w zakresie od 2,5 do 7,5. W przeciwnym razie kapsułki miękkie mogą wyciekać podczas przechowywania w wyniku kwaśnej hydrolizy żelatyny. Silna zasadowość może spowodować denaturację żelatyny i wpłynąć na rozpuszczalność miękkich kapsułek. Zawartość żelaza w surowcu żelatynowym kapsułek miękkich nie powinna przekraczać 0,0015%, aby uniknąć pogorszenia właściwości leków-wrażliwych na żelazo.